Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col24a1Q30D77 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms