Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsdmc2Q2KHK6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gsdmc2Q2KHK6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gsdmc2Q2KHK6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gsdmc2Q2KHK6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gsdmc2Q2KHK6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms