Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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