Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q149G0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q149G0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q149G0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q149G0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q149G0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q149G0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q149G0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q149G0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q149G0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q149G0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q149G0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q149G0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q149G0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms