Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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Spatc1Q148B6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Spatc1Q148B6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Spatc1Q148B6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Spatc1Q148B6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Spatc1Q148B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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Spatc1Q148B6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Spatc1Q148B6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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