Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gli2Q0VGT2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms