Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930480E11RikQ0VG34 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930480E11RikQ0VG34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms