Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim24Q0VG18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim24Q0VG18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim24Q0VG18 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms