Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd12Q0VE29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms