Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hif3aQ0VBL6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms