Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem52bQ0VBF2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms