Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms