Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5cQ0V8T7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5cQ0V8T7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms