Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata18Q0P557 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms