Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms