Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcnt1Q09324 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcnt1Q09324 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcnt1Q09324 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcnt1Q09324 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcnt1Q09324 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcnt1Q09324 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms