Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms