Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms