Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a2Q07643 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a2Q07643 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms