Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn3Q07409 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn3Q07409 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn3Q07409 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cntn3Q07409 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms