Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms