Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1bQ06985 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah1bQ06985 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms