Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox4Q06831 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox4Q06831 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms