Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Aplp2Q06335 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aplp2Q06335 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms