Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fmn1Q05860 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fmn1Q05860 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms