Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hspg2Q05793 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms