Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox8Q04886 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms