Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms