Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxcr5Q04683 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms