Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smpd1Q04519 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms