Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RelaQ04207 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms