Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tff2Q03404 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms