Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms