Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Runx1Q03347 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms