Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1sQ02789 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1sQ02789 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms