Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb4Q02738 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb4Q02738 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb4Q02738 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms