Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GscQ02591 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GscQ02591 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GscQ02591 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GscQ02591 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GscQ02591 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GscQ02591 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GscQ02591 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GscQ02591 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GscQ02591 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GscQ02591 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GscQ02591 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GscQ02591 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GscQ02591 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GscQ02591 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GscQ02591 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GscQ02591 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GscQ02591 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GscQ02591 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GscQ02591 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GscQ02591 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GscQ02591 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GscQ02591 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GscQ02591 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GscQ02591 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GscQ02591 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GscQ02591 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GscQ02591 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GscQ02591 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GscQ02591 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GscQ02591 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GscQ02591 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GscQ02591 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms