Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp39Q02525 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms