Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VcpQ01853 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms