Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2aQ01320 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2aQ01320 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms