Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EgfrQ01279 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EgfrQ01279 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms