Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gja5Q01231 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja5Q01231 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja5Q01231 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms