Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb2Q00977 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms