Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms