Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga4Q00651 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms