Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HmmrQ00547 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmmrQ00547 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms