Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp10Q000W5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp10Q000W5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms