Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IhhP97812 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IhhP97812 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
IhhP97812 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IhhP97812 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IhhP97812 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IhhP97812 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IhhP97812 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IhhP97812 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IhhP97812 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IhhP97812 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IhhP97812 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IhhP97812 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IhhP97812 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IhhP97812 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IhhP97812 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IhhP97812 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IhhP97812 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IhhP97812 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IhhP97812 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IhhP97812 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IhhP97812 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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