Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas1P97459 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms