Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nbr1P97432 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nbr1P97432 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms